1949年5月25日沪西解放。此时，中共交通大学组织是总支部。是日清晨，交大师生中散居校外的人民保安队员1000多人奔走相告，上午大批师生赶回学校，校园一片欢腾；中午党总支部组织学生1000多人的宣传小队到工厂区、贫民区、住宅区……宣传解放。

接着用一周时间重整被国民党军队严重破坏了的校园、设备，于6月2日全部复课。6月5日交大师生员工、夜校学生及其他学校学生代表2000多人在新文治堂（现徐汇校区大礼堂)举行史霄雯、穆汉祥烈士追悼会，上海市委青年工作委员会（简称市青委）负责人致悼词。会后，烈士遗体安葬在校园里。翌年，建立纪念碑，陈毅市长题词：“为人民利益而牺牲是光荣的”；交通大学首届校务委员会主任吴有训题词：“我们誓踏着你们的血迹前进，为建设新民主主义新中国而斗争”。

6月12日组成上百个小分队，投入了取缔银元贩子的斗争。15日，中国人民解放军上海市军事管制委员会(简称军管会)派遣唐守愚等接管学校，在新文治堂举行交接仪式。6月19日开始，由学生800人、教师、职工100人组成90个清点小队，在军管会领导下，用10天时间，清点了全部财产。6月21日在达人中学召开交大新青联全体会员大会，会上宣布批准交大建立新民主主义青年团，新青联会员转为团员，9月正式成立团委。党总支还领导了历届学生会改选，成立交大教育工会、交大妇女联合会，并加强对“教师协会”的领导。

7月6日下午师生员工参加全市庆祝上海解放大游行。10月1日庆祝中华人民共和国诞生，全体师生员工在大草坪举行升国旗典礼，并在校内游行。8日1000多人参加全市庆祝开国暨保卫世界和平百万人示威大游行，交大的队伍抵达新世界时，还被拍摄了《全中国人民的解放》、《全世界人民的胜利》大型纪录片中的部分镜头。

1950年1月17日中共交大地下党组织公开，张贴红榜公布地下党员名单，并召开第一次党员大会，邀请党外积极分子数百人参加。明确党组织的任务从解放前领导学生运动为主转变为团结师生搞好教学，建设新交大。号召党、团员带头学习、争取优良成绩，带动同学，掀起学习热潮。围绕这一中心，搞好自身建设，加强以教职工为重点的建党工作，还陆续选留党员应届毕业生，充实教师干部队伍。

在此期间，认真组织师生员工开展政治学习。1950年11月，全国掀起抗美援朝运动，学校开展时事学习、宣传，批判亲美、崇美、恐美等不正确的思想，激发了师生员工的爱国热情，出现了自觉慰劳捐献，近千名学生争先恐后报名参加军干校等一系列的爱国行动。1951年初全国开展镇压反革命运动，4月20日全校举行对反革命分子、特务分子的控诉大会。

在此期间，急国家之所急，向各条战线输送三四年级学生。如二六轰炸后，输送航空、电机系近20人参军，成为新上海的第一批雷达兵；土木系、水利系四年级学生71人参加根治淮河壮举；运输系学生数十人支援东北铁路建设；输送学生30人参加南下工作团；输送学生392人参加军干校……。在输送人才中有近百名党员。另外还抽调了党员骨干近二十人充实到各级党政机构，加强了各级人民政权的建设。