1957年7月～1958年7月交通大学党委根据中共中央的指示和上海市委的部署，开展了整风运动和反右派斗争。其间经历了学习动员、大鸣大放、反右派斗争、整改、再鸣放辩论、反右派斗争补课、全民整风批判资产阶级个人主义、再整改等阶段。在整风运动中，揭露了党委领导工作中存在的不少问题，建立了整风委员会和几个专门小组研究整改方案。公布了“关于克服官僚主义、主观主义、宗派主义，克服特殊化，改善党群关系，改进党委领导的几项措施”、“关于扩大民主、加强集体领导”、“改进教职员政治理论学习，加强社会主义思想教育”等四个方案，交群众广泛讨论征求意见。修改后由党委扩大会作出了“关于改进和加强党对学校的领导的决议”并开始试行。在反右斗争阶段，由于“左”的思想指导严重扩大化。教职员和学生300多人被错划为“右派分子”，其中学生占总数的82.5%。1959年开始到1961年底，学校党委按照中央和市委的指示，对在校的教职员中大多数错划的“右派分子”摘掉了帽子，直至中共十一届三中全会后，教职员和学生被错划的“右派分子”才全部得到纠正。