抗战胜利后，交大沪校的党支部，属临时大学区委领导。交大渝校迁回上海，原属南方局（和它的延续南京局）青年组领导的“据点”，组织关系不变。在“反甄审”斗争中转来交大学习的原南京中央大学、雷士德工学院等学生党员15人，组织关系转入交大。1946年9月组建交大总支部，属国立大学区委领导，吴增亮任书记、沈讴任副书记，委员有俞宗瑞、朱爱菊、叶公毅，总支下设4个分支部和1个学生自治会党团。1947年5月，由南方局青年组领导的“据点”划归上海局领导，7月初一度组建独立支部，9月转入交大总支，总支委员会有俞宗瑞（书记）、朱爱菊、李国富、庄绪良、袁嘉瑜、姚欣茂。1948年5月初，总支委员会由庄绪良任书记，委员有唐恒治、钟垒、袁嘉瑜、陈楷。同年9月，总支委员会庄绪良任书记、陈启懋任副书记，委员有张仁旭、穆汉祥。1949年初，穆汉祥调到地区工作后,委员增补了吕甦、张仁昶、赵国士、严祖礽。党员数量比1945年时扩大了近7倍，到上海解放时有198人(不包括历次撤退到解放区和输送到别的战线上去的党员100多人) ,党的秘密外围组织新民主主义青年联合会(简称“新青联”)会员达400多人(含党员200人)。

　　解放战争时期，中共交大党组织根据当时党的总路线，始终遵循“隐蔽精干、长期埋伏、积蓄力量、以待时机”的白区工作方针，结合交大实际有理有节地开展了各项工作，与全国学生和各界人民革命运动结合在一起，在国民党统治的心脏地区上海，接连不断地投入到爱国民主运动中。从反对甄审到争取和平，从护校运动到反饥饿反内战反迫害，从救饥救寒到反美扶日，从真假和平辩论到迎接解放，取得一次次的胜利，称为战斗在第二条战线上一支强大的生力军。交大党组织的领导和组织能力不断成熟，其领导的学生运动恰如一股扑不灭的火焰，愈燃愈烈，被誉为“民主堡垒”。解放战争时期党领导的学生运动因斗争形势的变化，大体上可以分为以下四个阶段：

　　一、反内战争和平（从抗战胜利到1946年6月）。抗日战争胜利后，国民党为了抢夺胜利果实，对原沦陷区实行“劫收”，对原沦陷区公立专科以上学校的学生实行“甄审”。为争取广大学生的读书权利，交大党组织在中共上海学委领导下，带领群众开展了反“甄审”斗争，并取得胜利。为争取和平民主，交大师生在地下党组织领导下，积极参加了“迎接马歇尔”、“公祭于再”、“助学尊师”、救灾反内战等一系列反内战争民主活动。这些斗争揭露了国民党反动派发动内战的阴谋，提高了广大师生的思想觉悟，壮大了党的队伍。

　　二、护校运动与五二○运动（1946年6月到1947年6月）。国民党政府在美国政府的支持下发动全面内战，并加紧镇压其统治区域的人民革命活动。上海地下党组织积蓄和发展革命力量，最大限度地团结各阶层人民，坚决领导各阶层群众开展了一系列反美反蒋斗争。中共交通大学党组织加强了组织建设和思想教育，提高了党的战斗力，通过学生会、学生社团等合法形式，发动广大学生群众参加了抗议美军暴行运动，赢得了“贾子干事件”的胜利，开展了大规模的护校斗争，积极投入反饥饿、反内战、反迫害运动。

　　三、反美扶日运动（1947年6月到1948年7月）。1947年6月，解放战争已从战略防御转为战略进攻阶段，敌我力量对比正在发生根本的变化。中共上海党组织领导下的青年爱国民主运动，对人民解放战争起了积极的配合作用，成为第二条战线上的一支重要力量。交通大学党组织认真学习理论和党的指示，总结学生运动的斗争经验，加强自身组织建设，壮大革命力量，团结和领导广大学生群众，开展了救饥救寒运动、抗议九龙暴行、声援同济大学一二九事件等一系列斗争，交大成为上海学生开展“反美扶日”运动的主战场，被誉为“民主堡垒”。

　　四、迎接解放（1948年7月到1949年5月）。1948年秋，解放战争已进入战略决战阶段。蒋介石政府为挽救败局，颁布“改革经济”、“肃清匪谍”、“安定后方”等一系列法令，更加疯狂地镇压国统区的民主斗争。穆汉祥、史霄雯在解放前夕惨遭杀害。中共交大党组织在上级领导支持下，紧紧依靠群众，通过学生自治会改制、将工作重心从社团移到班级、发动宣传攻势、组建新青联、举办真假和平辩论会等措施和灵活的斗争策略，在最艰难的环境中，组织和团结师生员工，创造性地开展工作，有效地制止敌人最后的大破坏。在发展壮大自身力量的同时，为保护学校和地区人民的生命财产，为迎接上海解放进行英勇的斗争。