校党委从1981年2月起就向中央及部委有关领导请示上海交大的归属问题(1970年1月29日国务院、中央军委决定，从1970年2月25日起将上海交通大学改归六机部建制并领导)。是年二三月间，党委领导两次赴京，向六机部(后改为中国船舶工业总公司)、国家计委、机械委员会领导柴树藩等请示调整交大归属教育部等问题，获得了他们的支持。1982年9月17日教育部、中国船舶工业总公司下达“关于改变上海交通大学领导关系的通知”。“通知”提出“为了加强统一领导，进一步发挥上海交通大学的作用，为国家培养更多更合格的科技人才，国务院已正式批准，将中国船舶工业总公司所属上海交通大学移交给教育部领导，实行教育部与上海市双重领导，以教育部为主。”“领导关系改变后，仍为全国重点高等学校，现有专业要继续办好，并应继续与中国船舶工业总公司保持密切联系”。

1982年11月27日至30日，由中国船舶工业总公司、教育部、市高教局、交大党委等领导参加，在学校举行交接工作会议。并于12月3日学校向教育部、中船总公司、国家计委、市教卫办、市高教局上报“关于改变上海交通大学领导关系的交接工作会议纪要”，正式完成了交接工作。